Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11cB4XVP9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11cB4XVP9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf11cB4XVP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.5 ms