Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clrn2B2RVW2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clrn2B2RVW2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clrn2B2RVW2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms