Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf3B2RQG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Phf3B2RQG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf3B2RQG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf3B2RQG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms