Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap42B2RQE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap42B2RQE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap42B2RQE8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap42B2RQE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms