Protein–RNA interactions for Protein: B2KGE5

Fam229a, Protein FAM229A, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam229aB2KGE5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Fam229aB2KGE5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Fam229aB2KGE5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Fam229aB2KGE5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms