Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spocd1B1ASB6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spocd1B1ASB6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Spocd1B1ASB6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spocd1B1ASB6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms