Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slfn8B1ARD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slfn8B1ARD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn8B1ARD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn8B1ARD8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms