Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttll2A4Q9E4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll2A4Q9E4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll2A4Q9E4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll2A4Q9E4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms