Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH7

Apol8, Apolipoprotein L 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol8A2VDH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol8A2VDH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol8A2VDH7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol8A2VDH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol8A2VDH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol8A2VDH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms