Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb1A2AQ07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb1A2AQ07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb1A2AQ07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb1A2AQ07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms