Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttll9A2APC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll9A2APC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms