Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GabreA2AMW3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GabreA2AMW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GabreA2AMW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabreA2AMW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GabreA2AMW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms