Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cavin4A2AMM0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cavin4A2AMM0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cavin4A2AMM0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cavin4A2AMM0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cavin4A2AMM0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cavin4A2AMM0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms