Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn3A2ALK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn3A2ALK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ptpn3A2ALK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn3A2ALK8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms