Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Frmpd1A2AKB4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Frmpd1A2AKB4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Frmpd1A2AKB4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Frmpd1A2AKB4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Frmpd1A2AKB4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Frmpd1A2AKB4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Frmpd1A2AKB4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Frmpd1A2AKB4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.3 ms