Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VirmaA2AIV2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VirmaA2AIV2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VirmaA2AIV2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VirmaA2AIV2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VirmaA2AIV2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.2 ms