Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RlfA2A7F4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RlfA2A7F4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RlfA2A7F4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RlfA2A7F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.1 ms