Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gpatch8A2A6A1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gpatch8A2A6A1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gpatch8A2A6A1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Gpatch8A2A6A1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Gpatch8A2A6A1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gpatch8A2A6A1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Gpatch8A2A6A1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms