Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Krtap29-1A2A5X4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krtap29-1A2A5X4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krtap29-1A2A5X4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms