Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l1A2A259 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l1A2A259 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkd2l1A2A259 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkd2l1A2A259 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms