Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4921501E09RikA0A0R4J054 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4921501E09RikA0A0R4J054 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms