Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms