Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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