Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Knop1Q9Z2Q2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms