Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms