Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms