Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd7Q9WTY1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd7Q9WTY1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms