Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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