Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms