Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trp53inp1Q9QXE4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms