Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms