Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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