Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2ird1Q9JI57 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms