Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pus3Q9JI38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms