Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcirg1Q9JHF5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms