Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms