Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn34b2Q9D9N2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn34b2Q9D9N2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn34b2Q9D9N2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn34b2Q9D9N2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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