Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn22Q9D7U6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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