Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce1Q9D720 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsmce1Q9D720 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms