Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhd1Q9D4J1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms