Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acbd6Q9D061 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Acbd6Q9D061 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms