Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc47Q9D024 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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