Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elp3Q9CZX0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms