Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS1

Rnf135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf135Q9CWS1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf135Q9CWS1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf135Q9CWS1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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