Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cnot11Q9CWN7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms