Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp3Q9CQ10 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms