Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NsmfQ99NF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms