Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms