Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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