Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms